Re: [問卦] 分子結構生物學的八卦

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作者 mother (老木)
時間 2022-11-08 11:50:19
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: 分子結構生物學主要的工作是測定蛋白質的基因序列,基本上前幾年如果能夠測序出一個 : 重要的蛋白質就可以發一篇高級論文。對於分子生物學的研究,獲得基因序列是起點和基 : 礎,只有拿到序列才能方便做後面的功能性研究。 : 谷歌旗下的人工智能公司DeepMind通過深度學習的AI算法開發出了一種蛋白質結構預測程 : 式AlphaFold,2018年推出後,在當年12月份舉辦的第13屆CASP(英語:Critical : Assessment of protein Structure Prediction,中文:蛋白質結構預測的關鍵評估)大 : 賽中排名第一,用幾天的時間成功地預測了被競賽組織者評為最困難的目標的最準確結構 : ,而以前這項工作需要至少幾個月甚至幾年的時間。 : 傳統的搞分子生物結構學的這幫人目前基本上被這個新的AI技術給擠兌的半死不活了,傳 : 統的結構生物學研究已經屬於夕陽產業,沒什麽前途了。 : 所以顏寧回來算是明智之舉,棄學從商從政是個最佳選擇。 : 聽起來不妙啊 有人知道這門科學嗎? █◣ █▆◣ 乖乖乖乖乖 乖乖乖乖乖 ▆█▁▂▁ ◥█ˊ ˋ健康快樂乖乖 營養好吃乖乖 ▇▅‘。’ ▂█ 你也乖乖 我也乖乖 乖乖的世界大家一起來 ▅▆︽︽︽ 健康快樂乖乖 營養好吃 ▄▅▆▅▄ (陪我一起長大的好朋友) 乖乖! lilywhcc 乖乖長大的<~Src~>想對<~Des~>說:<~Say~> 這是一個很好的問題 分子結構生物學是一門很好的學問 所謂師父領進門 修行在個人 人人為我 我為人人 人外有人 天外也有人 外星人 不過也有可能天外有魚 那就是外星魚 也就是火星章魚 或是魷魚 或是虱目魚 至於這門科學是什麼科學 那老木建議你要去問你的老師跟同學 或是可以自學 當然你也可以google看wiki學 或是等老木發這篇廢文 google wikiw複製貼上學 分子結構,或稱分子立體結構、分子形狀、分子幾何、分子幾何構型,建立在光譜學數據 之上,用以描述分子中原子的三維排列方式。分子結構在很大程度上影響了化學物質的反 應性、極性、相態、顏色、磁性和生物活性。[1][2][3] 分子結構最好在接近絕對零度的溫度下測定,因為隨著溫度升高,分子轉動也增加。量子 力學和半實驗的分子模擬計算可以得出分子形狀,固態分子的結構也可通過X射線晶體學 測定。體積較大的分子通常以多個穩定的構象存在,勢能面中這些構象之間的能壘較高。 分子結構涉及原子在空間中的位置,與鍵結的化學鍵種類有關,包括鍵長、鍵角以及相鄰 三個鍵之間的二面角。 溫度對其的影響 由於分子中原子的運動由量子力學決定,因此「運動」這個概念也必須要建立在量子力學 基礎之上。總體(外部)的量子力學運動——如平移和旋轉幾乎不改變分子的結構(由旋 轉導致的科里奧利力和離心扭曲以及由此導致的形狀變化在此可以忽略)。內部運動包括 振動,隸屬於諧波,即原子即使在絕對零度仍會在平衡間振盪。此時所有原子都處于振動 基態,具有零點能量,振動模式的波函數也不是一個尖峰,而是有限寬度的指數。隨著溫 度升高,振動模式(自由度)被熱激發,用通俗的話講是分子振動加快,而它們仍然只在 分子特定部分振盪。 玻爾茲曼分布可以量度溫度對分子振動的影響:{\displaystyle \exp \left(-{\frac {\Delta E}{kT}}\right)}\exp \left(-{\frac {\Delta E}{kT}}\right),其中 {\displaystyle \Delta E}\Delta E是振動模式的激發能,{\displaystyle k}k是玻爾茲 曼常數,{\displaystyle T}T是絕對溫度。在298K(25 °C)下,典型的玻爾茲曼因子值 為:ΔE = 500 cm-1 → 0.089;ΔE = 1000 cm-1 → 0.008;ΔE = 1500 cm-1 → 7 * 10-4。即,如果激發能為500 cm-1,那麼大約9%的分子在室溫時會處於熱激發態。對水分 子而言,其彎曲模式具有最低的激發能,大約為1600 cm-1,因此室溫下水分子中振動速 度比絕對零度時快的分子占不到0.07%。 雖然轉動很難影響分子結構,但作為一個量子力學運動,相對振動而言它在低溫下熱激發 程度較高。從經典力學角度來看即是,更多分子在高溫下轉動更快(它們具有更大的角速 度和角動量);而從量子力學角度看則是,隨溫度升高,更多角動量較大的本徵態開始聚 集。典型的轉動激發能數量級在幾cm-1。 由於涉及轉動態,很多光譜學的實驗數據都被擴大了。而轉動運動隨溫度升高而變得激烈 ,因此,低溫下的分子結構數據往往更加可靠,而從高溫下的光譜很難得出分子結構。 成鍵 根據定義,分子中的原子是由共價鍵連結起來的,包括單鍵、雙鍵、A鄭b춃nﰊ 上面在說什麼其實老木也看不懂 不是木不想學 去吃爭鮮迴轉壽司吃完更好學<(@[email protected])b -- 火星章魚 ~(@[email protected])~ ~(@[email protected])~ ~(@[email protected])~ ~(@[email protected])~ ~(@[email protected])~ ~(@[email protected])~ ~(@[email protected])~ /|||\ /|||\ /|||\ /|||\ /|||\ /|||\ /|||\ --
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seeback: 人家泛科學講得很好,來這裡卻看不懂了 163.22.65.77 11/08 11:51

bill403777: 看不懂但是肚子餓 來吃爭鮮\(@[email protected])b 42.73.163.161 11/08 11:52

SMeng: 老木午安 ~(@[email protected])~ ~(@[email protected])~ 爭鮮 啵棒 211.22.143.102 11/08 11:58

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